PDB ගොනු විවෘත කිරීම, සංස්කරණය කිරීම සහ පරිවර්තනය කිරීම
PDB ගොනු දිගුව සහිත ගොනුවක් බොහෝ දුරට ඉඩ ඇති ක්රමලේඛ දත්ත සමුදා ආකෘතියේ ගොනුවක් හෝ DLL හෝ EXE ගොනුවක් වැනි වැඩසටහන් හෝ මොඩියුලය පිළිබඳ දෝෂ සහගත තොරතුරු ලබා ගැනීමට භාවිතා කරන ලදි. ඒවා සමහර විට සංකේත ලිපිගොනු ලෙස හැඳින්වේ.
PDB ගොනුවේ සියළුම සංරචක සහ ප්රකාශයන් එහි අවසන් සංක්ෂිප්ත නිපැයුමේ මූලාශ්රය හා ප්රකාශයන් ලැයිස්තුගත කරයි. පසුව විබෙදන්නා හට මූලාශ්ර ගොනුව සොයාගත හැකි අතර, විභේධනය ක්රියාවලිය නතර කළ යුතු ක්රියාවලියේදී එම ස්ථානයේ සොයා ගත හැකි වේ.
සමහර PDB ගොනු වෙනුවට ප්රෝටීන් දත්ත බැංකු ගොනුවේ ආකෘතියේ විය හැකිය. මෙම PDB ගොනු ප්රෝටීන් ව්යුහයන් සම්බන්ධ ඛණ්ඩාංක ගබඩා කරන සරල පෙළ ගොනුවක් වේ.
අනෙකුත් PDB ගොනු සමහර විට පාම් දත්ත සමුදාය හෝ PalmDOC ගොනුවේ ආකෘතියෙන් නිර්මාණය වී ඇති අතර PalmOS ජංගම මෙහෙයුම් පද්ධතිය සමඟ භාවිතා වේ . මෙම ආකෘතියේ සමහර ගොනු වෙනුවට .PRC ගොනු දිගුව වෙනුවට.
PDB ගොනුව විවෘත කර ගන්නේ කෙසේද?
විවිධ වැඩසටහන් ක්රමලේඛ දත්ත සමුදා ආකෘතියක දත්ත ගබඩා කිරීම සඳහා තමන්ගේම PDB ගොනුවක් භාවිතා කරයි. එමනිසා එක් එක් යෙදුම ස්වකීය PDB ගොනුවක් විවෘත කිරීමට භාවිතා කරයි. ජෛවවිවිධත්වය, Intuit Quicken, මයික්රොසොෆ්ට් විෂුවල් ස්ටුඩියෝ, සහ Pegasus යනු PDB ගොනුවක් දත්ත සමුදා ගොනුව ලෙස භාවිතා කළ හැකි වැඩසටහන් කිහිපයක් වේ. රේඩාර් සහ PDBparse PDB ගොනු විවෘත කිරීම සඳහා වැඩ කළ හැකිය.
ඇතැම් PDB ගොනු සාමාන්ය පාඨයක් ලෙස ගබඩා කර ඇත, ජේගු 'ක්රමලේඛ Debug Database දත්ත ගොනුවක් ලෙස, සහ පාඨ සංස්කාරකයක විවෘත කළ විට ඒවා සම්පූර්ණයෙන්ම මානව-කියවිය හැකි වේ. ඔබට වින්ඩෝස් හි ඇති Notepad වැඩසටහන වැනි එවැනි පෙළ ලේඛන කියවිය හැකි ඕනෑම වැඩසටහනකින් මෙම PDB ගොනුව විවෘත කළ හැකිය. සමහර PDB ෆයිල් නරඹන්නන් සහ සංස්කාරකයන්ට Notepad ++ සහ Brackets ඇතුළත් වේ.
අනෙකුත් PDB දත්ත සමුදායන් ගොනු පෙළ ලේඛන නොවේ, එය අපේක්ෂා කරන වැඩසටහන සමඟ විවෘත කළ විට ප්රයෝජනවත් වේ. උදාහරණයක් ලෙස, ඔබේ PDB ගොනුව ඉක්මන් කිරීමට යම් ආකාරයකින් සම්බන්ධ නම්, එම PDB ගොනුව බැලීම හෝ සංස්කරණය කිරීම සඳහා එම මෘදුකාංගය භාවිතා කරන්න. ඩිජිටල් හෝ ඩීඑල්ඊ ගොනුව ලෙස ෆෝල්ඩරයේ PDB ගොනුව දැකීමට අපේක්ෂා කරයි.
ඔබට ප්රොජින් ඩේබන් බෑන්ඩ් ෆයිල්ස්, වින්ඩෝස්, ලිනක්ස්, සහ MacOS හි PDB ගොනු බලන්න සහ සංස්කරණය කළ හැකිය. Jmol, RasMol, QuickPDB සහ USCF හිමාෙරා PDP ගොනුව විවෘත කළ හැකිය. මෙම ගොනු සාමාන්ය පාඨයක් බැවින්, ඔබට PDB ගොනුව පාඨමය සංස්කාරකයක් ද විවෘත කළ හැකිය.
Palm Desktop දත්ත ගබඩා ගොනුවෙහි PDB ගොනු විවෘත කිරීමට හැකි විය හැකි නමුත් එම වැඩසටහන සඳහා .PRC ගොනු දිගුව හඳුනා ගැනීමට එය ප්රථමයෙන් නම් කිරීමට අවශ්ය විය හැකිය. PalmDOC PDB ගොනුව විවෘත කිරීම සඳහා, STDU Viewer උත්සහ කරන්න.
PDB ගොනුව පරිවර්තනය කරන්නේ කෙසේද?
ක්රමලේඛ දත්ත සමුදායන් බොහෝ විට වෙනත් ගොනු ආකෘතියක් බවට හැරවිය නොහැකි අතර, අවම වශයෙන් සාමාන්ය ෆයිල් පරිවර්තක මෙවලමක් සමඟ නොවේ. ඒ වෙනුවට, මෙම වර්ගයේ PDB ගොනුව පරිවර්තනය කළ හැකි මෙවලමක් තිබේ නම් එය විවෘත කළ හැකි එකම වැඩසටහන වේ.
උදාහරණයක් ලෙස, ඔබගේ PDB දත්ත සමුදාය ගොන්න Quicken වෙතින් පරිවර්තනය කිරීමට අවශ්ය නම්, එය කිරීමට එය භාවිතා කරන්න උත්සාහ කරන්න. කෙසේ වෙතත් මේ ආකාරයේ පරිවර්ථනය බොහෝ විට භාවිතා නොකරනවා පමණක් නොව, මෙම දත්ත සමුදායේ යෙදීම්වලට සහය නොදක්වයි (එනම් ඔබට මෙම වර්ගයේ PDB ගොනුව වෙනත් කවර හෝ ආකෘතියක් බවට පරිවර්තනය කිරීමට අවශ්ය නොවේ).
ප්රෝටීන් දත්ත බැංකු ගොනු MeshLab සමඟ අනෙකුත් ආකෘති වෙත පරිවර්තනය කළ හැකිය. මෙය කිරීමට නම්, ඔබ ප්රථමයෙන් PDB ගොනුව WRL වෙත PyMOL වෙත පරිවර්තනය කල යුතුවේ, > ගොනුව> Save Image As> VRML මෙනුව, පසුව MeshLab තුල WRL ගොනුව ආයාත කර, පසුව PDB වෙත පරිවර්තනය කිරීම සඳහා File> Export Mesh As මෙනුව භාවිතා කරන්න. ගොනුව STL හෝ වෙනත් ගොනු ආකෘතියක් වෙත ගොනු කරන්න.
ඔබට වර්ණ විය යුතු ආකෘතිය අවශ්ය නොවේ නම්, ඔබට PDB ගොනුව STL වෙත STC USCF චයිමේරා (බාගත කිරීමේ සබැඳිය ඉහළින්) නිර්යාත කළ හැකිය. එසේ නොමැති නම්, ඉහත සඳහන් කළ ක්රමය (MeshLab සමඟ) ඉහත ආකාරයටම භාවිතා කළ හැකිය. PDP වෙත WRL වෙත WRL සමඟ USCF චයිමේරා සමඟ WRL ගොනුව MESLAB සමඟ STL වෙත අපනයනය කල හැකිය.
PDB to PDF or EPUB බවට පරිවර්තනය කිරීම සඳහා, ඔබට PalmDOC ගොනුවක් තිබේ නම්, බොහෝ ක්රම හැකි නමුත් පහසුම වේ, සමහර විට Zamzar වැනි සබැඳි PDB පරිවර්තකය භාවිතා කිරීමට විය හැකිය. ඔබට එම ආකෘති වලට මෙන්ම AZW3, FB2, MOBI, PML, PRC, TXT සහ වෙනත් eBook ගොනු ආකෘති වෙත පරිවර්තනය කිරීමට ඔබට එම වෙබ් අඩවියේ ඔබගේ PDB ගොනුව උඩුගත කළ හැකිය.
PDB ගොනුව FASTA ආකෘතියට පරිවර්තනය කිරීම සඳහා Meiler Lab හි මාර්ගගත PDB වෙත FASTA පරිවර්තකයට කළ හැකිය.
PDBx / mmCIF භාවිතයෙන් PDB පරිවර්ථනය (Crystallographic Information Format) ඔස්සේ PDB බවට පරිවර්තනය කළ හැකිය.
PDB ගොනු මත උසස් කියවීම
Microsoft, GitHub සහ Wintellect වෙතින් වැඩසටහන් දත්ත සමුදායන් ගැන වැඩි විස්තර දැන ගත හැකිය.
ප්රෝටීන් බෑන්ක් ෆයිනෑන්ස් ෆයිල්ස් ගැනද දැන ගැනීමට තවත් බොහෝ දේ ඇත. ලෝක ව්යාප්ත ප්රාග්ධන දත්ත බැංකුව සහ RCSB PDB බලන්න.
ඔබගේ ගොනුව තවමත් විවෘත නොවේද?
PDB ගොනු ඉහත සඳහන් මෙවලම් සමඟ විවෘත නොකරන, සමහර විට PDB ගොනු නොවේ. සිදුවීමට ඉඩ ඇති දෙය නම් ඔබ ගොනු දිගුව වැරදි ලෙස කියවීමයි. සමහර ගොනු ආකෘති සැබැවින්ම අසම්බන්ධිත වූ විට සහ "එකම කාර්යය" නොකරන්නේ නම් ".PDB" ඉතා සමීපව සමානයි.
උදාහරණයක් ලෙස, PDF ගොනුවකි ලේඛන ගොනුවකි නමුත් ඉහළින් ඇති වැඩසටහන් බොහොමයක් මෙම මෘදුකාංග වැඩසටහන් සමඟ විවෘත කිරීමට උත්සහ කරන විට පෙළ සහ / හෝ රූප නිවැරදි නොකරනු ඇත. PD, PDE, PDC සහ PDO ගොනු වැනි සමාන ගොනු විස්තාරිත ගොනු සහිත අනෙකුත් ගොනු සඳහාද මෙය සත්ය වේ.
PBD යනු EaseUS Todo Backup වැඩසටහනට අයත් වන අතර එය එම මෘදුකාංගය සමඟ විවෘත කළ විට ප්රයෝජනවත් වේ.
ඔබට PDB ගොනුවක් නොමැති නම්, එය විවෘත කිරීම හෝ පරිවර්තනය කිරීම සඳහා සුදුසු වැඩසටහනක් සොයා ගත හැකි වන පරිදි ඔබේ ගොනුව තුල ඇති ගොනු දිගුව පිළිබඳව පර්යේෂණ කරන්න.